知・徳・体のバランスのとれた人材の育成を目指す。人間教育「キリスト教主義に基づく愛と祈りと奉仕」・読書教育「スタディ・スキルを身につけ知の探求者をめざす」・英語教育「グローバル・スタンダードにおける基礎学力」・保健体育教育「人生を、心身のバランスよく楽しく生きる基礎健康力」・芸術教育「人生の豊かさ、感動とインスピレーション」を５つの柱として教育を行う。

1886（明治19）年、宣教師ランバス博士が「読書館」を開設、翌年パルモア学院となる。89年、中間部が独立し関西学院を設立。1923（大正12）年、女子部がパルモア女子英学院として独立、40（昭和15）年、啓明女学院となる。2002（平成14）年、共学化し（関西学院大継続）啓明学院中学校が誕生。2023（令和5）年には創立100周年を迎えた。

六甲連山の西端、緑深い横尾山の麓にレンガ色の屋根の校舎が建ち並ぶ。荘厳なチャペル、明るい食堂、音楽ホール、エアドームプール、ナイター照明付のテニスコートや人工芝グラウンドなど充実した設備を誇る。瀬戸内市牛窓に前島キャンプ場、備前市に啓明備前焼工房等をもつ。

男女共学の啓明学院は、関西学院10年一貫教育のさらなる充実を目指す。「自分で問題を見つけ、自分で調べ、自分で答を見出し、解決する」、これを学問の基本と考えるため、自学自習の精神と習慣を早く身につけることに力を注ぐ。そのために、「読書」に重点をおいた指導を行っている。「読書」の授業では、習慣付けとともに「考える力」「書く力」を養成。また、英語教育には長い伝統があり、まずは「聞く」「話す」に重点をおき、英語を好きになる学習を進める。もちろん「読む」「書く」力も中学３年間できっちりと養う。土曜選択講座として教養系・理数系・芸術系等多彩な講座が開講されている。

プロテスタント校らしく、クリスマスやイースターなどさまざまな宗教行事を実施。奉仕活動にも熱心。どんな条件下でも、自分の力を存分に発揮するためには「健康と体力」が不可欠という考えからスポーツも重視。スポーツを奨励することで、「不屈の精神」「フェアプレーの精神」「強い意志」を鍛練していく。男女とも、毎日の駆け足を日課とするほか、水泳実習にも力を入れる。また、「体験」をキーワードに多くの行事を実施。2009年より高校は共学募集となった。併設中からの内進生と同様、基準を満たせば関西学院大に進学できる。

・入試に向けて予想したR4（※）偏差値一覧
・入試結果R4（※）偏差値一覧

※『R4』とは、合格可能性を示す数値で、偏差値による合格率の各段階（RANGE＝レンジ）を示し、『R4＝80%、R3＝50%、R2＝20%』を意味します。